Die Kirche wurde im VIII Jh. nahe den Ruinen des Minervatempels errichtet und wurde im Laufe der Zeit oft verändert. Aufgrund der vielen Kunstwerke in der Kirche von St. Maria sopra Minerva, wird die Kirche als eines der ersten „Kirchenmuseen“ in Rom anerkannt. Künstler wie Filippino Lippi und Andre Bregno haben zu ihrer Pracht beigetragen.