Laut der Tradition, wurde 8 v. Chr. dort wo St. Agnese zur Märtyrerin gesprochen wurde, ein Oratorium gebaut. 1652 beauftragte Papst Innocent X Girolamo Rainaldi und dessen Sohn Carlo die Kirche als eine Familienkappelle neben seinem Palast zu rekonstruieren. Von 1653 bis 1657 nahm Borromini die Arbeit auf sich. Die Arbeiten der Kirche wurden Ende des XVII Jh. beendet.